枕大池蛛网膜囊肿有两大原因，一种是先天性的因素，在临床上也称为原发性蛛网膜囊肿，是孩子在胚胎时期就已经形成了，跟脑积液积聚异常有很大的关系。而还有一种则是后天性因素引起的，可能是由于孩子出生之后颅内出血或者出血的颅内感染，这些都有可能会引起孩子患病。