跑步后喉咙痛是由于环境、气流刺激喉咙引起；喉咙较狭窄，跑步时气流冲击喉咙，引起喉咙痛；气管有炎症或邻近器官有炎症，刺激喉咙神经，跑步以后的气流刺激，继而引起喉咙痛。
跑步，尤其是现在北京市“半马”，群众参与的马拉松跑步活动越来越多，这种跑步喉咙痛
是越来越常见的一种表现。
首先，喉咙这地方有非常丰富的神经末梢，对环境的刺激，对进气量，对气流的冲击有反应。这种冲击，这种刺激达到一定程度会引起疼痛，再剧烈可能会引起咳嗽、有痰的情况。
其次，喉咙这个地方是整个气道里最狭窄的地方，本来这个气流对就有刺激。当跑步的时候，尤其是剧烈的跑步，这种气流的冲击是很强烈的，这种气流本身的冲击，由于空气动力学，这种湍流就会冲击喉咙引起不适。跑步越剧烈，这种不适感可能会越多。尤其是对一些初跑者、初学者。
再有，如果说对一些病人，比如说是咽喉炎的病人，是感冒后的病人，是一个气管有炎症的病人，或者可能邻近器官有炎症，比如说有鼻炎，比如说有反流性食管炎，这种炎症都会刺激，使喉咙这地方神经处于一种很敏感的状态。喉高度敏感，对这些跑步以后
引起的气流刺激，尤其是在冬天，这种寒冷的刺激就会反应很剧烈，就会引起喉咙疼痛，甚至于会引起反射性的不单是喉咙疼痛，可能还会引起反射性的耳部疼痛，甚至于头疼、肩膀疼都会引起，这是一种神经的疼痛，这种疼痛可以做一些预防。
比如说逐渐从屋里到寒冷的地方，要有一个过渡。再有，可以做一些防护，比如说寒冷的时候，穿一些高领衫，戴一些薄的围脖。雾霾的时候，避免过度干燥刺激的环境，在这个环境下跑步，尽量避免这些情况。跑步以后喉咙疼痛，这种程度和发生的频率就会减低。