巧克力囊肿在手术后有复发的可能性的，因为巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，它是指具有生长功能的子宫内膜移位到了卵巢上，从而形成卵巢巧克力囊肿，这种疾病手术后的复发率是比较高的，一般在百分之五十左右，所以临床上为了降低巧克力囊肿术后的复发率，在术中要处理是比较关键的。如果囊肿与周围组织有致密的粘连，以及与肠管、输尿管有致密的粘连，在此时应该尽量的彻底清除病灶，以及与之相连的粘连带，必要时需要请其他科室的医生共同完成手术，而且一定要注意在术后要应用GNRHA类的药物，或者是地诺孕素等等来进一步的降低手术后的复发几率。

女性患有卵巢巧克力囊肿，随着病程的延长，囊内的积血会不断的增加，从而导致囊肿的体积逐渐的增大。当囊腔内的积血过多，压力过高时，既可以撑破囊壁薄弱部分而发生囊肿破裂，囊内流出的积血会导致盆腔内的移位病灶的发生，而反复的破裂之后会刺激腹膜，引起剧烈的腹痛，并可以造成盆腔器官的粘连，而且在一定的诱因下，有也有可能发生破裂，比如粗暴或者剧烈的性生活，尤其是在经前期进行性生活是导致最为常见的巧克力囊肿破裂的重要诱因。女性在平时日常生活中应该避免受到外力的挤压，不要进行过于激烈的性生活。

对于卵巢囊肿的后遗症，主要是由于手术后导致的后遗症，出现卵巢囊肿手术后，如果手术过程中没有保护好卵巢的功能，会发生卵巢功能受损，从而影响女性的月经，而且手术后容易造成盆腔的粘连。患者会出现性生活后，腹部出现疼痛，严重者会影响女性的性生活的质量，而且术后也容易发生肠粘连，这种疾病的几率会更高一些，所以一般建议做完子宫内膜异位症，卵巢囊肿手术的患者一定避免过早进食，一定要等到排气后才慢慢的进一些流质或者半流质的食物，这样就不会容易发生肠粘连，而且要积极配合医生进行治疗，适当的下地活动，有助于帮助肠道的蠕动。

巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种常见类型，跑出子宫腔的异位内膜在卵巢生长，形成囊肿。既然是内膜，即使不在子宫腔，它也会受到月经周期雌孕激素波动的影响，来一次月经，就长一点。然后脱落的内膜又不能像月经一样排出，只能呆在囊肿里，越积越多。这些陈旧性的出血，样子类似巧克力液，所以俗称巧克力囊肿，学名是“卵巢子宫内膜异位囊肿”。巧克力囊肿的主要症状是痛经、不孕和盆腔包块。如果巧克力囊肿比较大，可能发生破裂，引起剧烈腹痛，需要急诊手术治疗。巧克力囊肿，药物治疗通常是不敏感的，手术治疗是首选的治疗方法。巧囊和卵巢子宫内膜样癌，透明细胞癌之间的关系密切，巧克力囊肿恶变率约为1％，手术可以除外巧囊恶变，或者避免夜长梦多，避免时间久，病程长，囊肿性质的变化。

卵巢巧克力囊肿严重吗？那就要看这个患者她到底有没有什么临床症状。如果说这个患者她是因为不孕症来做检查，而发现卵巢的巧克力囊肿，那就有可能是因为这个卵巢的巧克力囊肿导致了患者的不孕。从这点来讲它就比较严重了。那么卵巢的巧克力囊肿一般它没有症状，但是当它出现巧克力囊肿破裂的时候，患者会出现严重的剧烈的腹痛。那么这个时候这个巧克力囊肿，从这个角度来讲，它就很严重了。因为对患者的造成了严重的腹痛，造成了不舒服的感觉。那么还有将近1%的患者卵巢巧克力囊肿会发生恶变。那么恶变对于一个患者来讲，也是一个非常严重的事件。所以卵巢巧克力囊肿，当它没有症状的时候，它不严重，但是当它导致你不孕、腹痛、甚至是有恶变的时候，它就非常的严重。因此我们应该定期的进行复核检查，看看卵巢是不是长了巧克力囊肿。