引起斑秃的原因有遗传因素、骨密度的异常和孩子体内微量元素失衡、惊吓和惊恐、成年人真菌感染、内分泌系统的疾病等。
很多儿童和成年人都会出现斑秃。其中遗传因素是很重要的原因，约有10%-20%的斑秃患者会有家族遗传史，遗传性过敏性体质患者易伴发斑秃，这些提示遗传可能是病因之一，斑秃与遗传缺陷是密切相关的。
儿童斑秃最大因素就是骨密度的异常和孩子体内微量元素失衡。儿童出现斑秃现象一般都有儿童自己本身的特点。从神经因素上来讲，导致儿童斑秃的最大因素就是惊吓和惊恐。成年人真菌感染导致的斑秃、内分泌系统的疾病也会引起斑秃，比如甲状腺疾患合并斑秃者特别多，其中与甲状腺功能亢进的关系更为密切。
育龄期妇女，斑秃往往会自愈，但在分娩后脱发又可复发，和体内分泌雌激素、雄激素、孕激素密切相关。部分斑秃的患者在出现斑秃之前具有外伤史。比如：车祸史或者头部外伤史，甚至部分患者具有脑震荡的病史，这些情况下会导致患者局部血流障碍，神经支配异常，交感神经兴奋，从而导致斑秃的发生和加剧。