药物治疗分为西药和中药，目前以西药当中，抗抑郁药物应用的是比较多的。
目前最常用的有5-羟色胺再摄取抑制剂和5-羟色胺去甲肾上腺素再摄取抑制剂。研究表明，抑郁症患者大脑里边负责神经传递的神经递质功能不足，尤其是负责情绪的三个重要的递质，5-羟色胺、去甲肾上腺素和多巴胺的功能不足。这一类药物，就是提高5-羟色胺、去甲肾上腺素或多巴胺功能的，从而发挥抗抑郁的作用。5-羟色胺再摄取抑制剂共有6种药物，氟伏沙明、帕罗西汀、舍曲林、西酞普兰和艾司西酞普兰、氟西汀，主要的作用就是提高中枢5-羟色胺神经的功能，这是目前比较常用的。
去甲肾上腺素和5-羟色胺再摄取抑制剂，主要有文拉法辛、度洛西汀和米纳普伦。这一类药物是提高大脑里面5-羟色胺和去甲肾上腺素功能的，这些药物的特点是对重型的抑郁症、对伴有疼痛的、对伴有多种多样躯体不适的抑郁症患者效果不错。其中度洛西汀和米纳普仑，效果更优一点。
刚才讲到的5-羟色胺再摄取抑制剂，那六种药当中疗效不错的，主要是帕罗西汀、艾司西酞普兰，那四种药物也各自有各自的特点和优点，兰释（氟伏沙明）对强迫症效果不错，氟西汀对进食障碍、厌食、贪食症效果不错。舍曲林对儿童抑郁症和老年抑郁症是首选。西酞普兰对于有关心脏病的抑郁症患者，也是首选之一。可以说是龙生九子、子子不同。这些药物各自有各自的特点，虽然是一类药，但是也有明显的不同点。
另外中医药对于轻度抑郁症效果也是不错的。中医认为，抑郁症属于郁证，主要的辩证有肝郁气滞、肝郁脾虚、心肾不交、肾虚等等不同的类型，多用疏肝理气、健脾补肾之法，常用的方剂逍遥散、柴胡舒肝散等等。中药对抑郁症，尤其轻度抑郁症效果也是不错的，而且不良反应比较轻微。