卵巢“巧克力囊肿”是子宫内膜异位症的一种类型。卵巢“巧克力囊肿”病变可只累及一侧卵巢，但约有百分之五十以上的患者会累及双侧卵巢。随着病情的发展，患者可出现痛经、持续性下腹疼痛、月经失调、不孕和性交痛等病症。

卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，一般情况下是不具备传染能力的。

正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，这种异位的子宫内膜也受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，如病变发生在卵巢上，每次月经期局部都有出血，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性血呈褐色，黏稠如糊状，似巧克力，故又称“巧克力囊肿”。

这种囊肿虽然很少发生恶变，但由于它可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，同样是非常危险的，而且还可能会导致女性不孕不育，所以一定要积极配合治疗。在治疗上通常有以下方法：

可采用药物或(和)手术治疗(保守性或根治性)。迄今为止，除根治性手术外，尚无一种理想的根治方法。无论是药物治疗抑或保守性乎术均有相当高的复发率。因此，应根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求等加以选择，强调个体化治疗。症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗;有生育要求的轻度患者明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术;年轻无生育要求的重症患者可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗;症状及病变均严重的无生育要求患者可行根治性手术。

手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病最佳处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。